在设计蛋白质之前我只想对一个蛋白质结构进行快速的relax以下脚本能不能实现？ROSETTASCRIPTS SCOREFXNS ScoreFunction name=scorefxn SCOREFXNS TASKOPERATIONS ResidueTypeRestriction name=no_design TASKOPERATIONS

是的，这个脚本可以实现快速的relax，使用的是默认的relax脚本。其中，ResidueTypeRestriction操作可以禁止蛋白质中的氨基酸进行设计，只进行构象优化；Sasa filter可以计算蛋白质的溶剂可及表面积，用于评估relax后的构象是否更稳定。

原文地址: https://www.cveoy.top/t/topic/cpYp 著作权归作者所有。请勿转载和采集!