rosetta蛋白质设计软件中RestrictConservedLowDdg name=ddg ddG_filename=ddg_predictionsoutconservation_cutoff=06 ddG_cutoff=15 verbose=1 force_similar=1什么意思
这段代码是Rosetta蛋白质设计软件中的一个限制条件,指定了一个名为"ddg"的限制条件,限制条件的定义来自于一个名为"ddg_predictions.out"的文件,该文件包含了蛋白质序列的保守性信息和预测的蛋白质稳定性变化值(ddG)。保守性信息的阈值为0.6,稳定性变化值的阈值为1.5。如果保守性信息和稳定性变化值符合这些限制条件,则该蛋白质序列可以被接受。如果verbose=1,则会输出详细的信息,如果force_similar=1,则会强制要求设计的蛋白质结构与参考结构相似。
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