rosetta蛋白质设计软件中ConservedPosMutationFilter name=conserve_mutddG_filename=ddg_predictionsout conservation_cutoff=06ddG_cutoff=15 max_conserved_pos_mutations=5什么意思

这段代码是Rosetta蛋白质设计软件中的一个保守性突变过滤器，其作用是根据蛋白质序列的保守性信息，筛选出保守性较高的氨基酸残基进行突变设计。具体参数解释如下：

• name="conserve_mut"：过滤器的名称。
• ddG_filename="ddg_predictions.out"：ddG预测结果文件的名称。
• conservation_cutoff=0.6：保守性阈值，保守性得分高于该值的氨基酸残基会被筛选出来。
• ddG_cutoff=1.5：ddG预测结果的阈值，只有ddG值低于该值的突变才会被保留。
• max_conserved_pos_mutations=5：最大保守性突变数，即最多允许突变的保守性氨基酸残基数量。