rosetta蛋白质设计软件中EnzRepackMinimize name=fin_min repack_only=0 design=0scorefxn_minimize=myscore scorefxn_repack=myscore minimize_rb=1minimize_sc=1 minimize_bb=1 cycles=1task_operations=edto_arolimchi2ca
这是一个Rosetta蛋白质设计软件的命令,意思是进行酶的重构和最小化,不仅重新排列氨基酸,还进行设计。使用的评分函数是“myscore”,同时进行旋转键和侧链的最小化,并且只进行1个循环。任务操作包括“edto_aro”(将环氨基酸转化为芳香族氨基酸)、“limchi2”(限制侧链二面角)和“catres”(将催化残基标记为活性)。
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