这是一个关于 Rosetta 蛋白质设计软件中的 EnzRepackMinimize 操作的命令,具体含义如下:

  • name=desmin:命名为 desmin。
  • design=1:进行设计操作。
  • repack_only=0:同时进行重构和设计。
  • scorefxn_minimize=myscore:使用自定义的 myscore 评分函数进行最小化。
  • scorefxn_repack=soft_rep:使用 soft_rep 评分函数进行重构。
  • minimize_rb=1:进行侧链和主链的最小化。
  • minimize_sc=1:进行侧链的最小化。
  • minimize_bb=0:不进行主链的最小化。
  • cycles=2:进行两个循环。
  • minimize_lig=1:进行配体的最小化。
  • min_in_stages=0:不分阶段进行最小化。
  • backrub=0:不进行 Backrub 操作。
  • task_operations=edto_aro,limchi2,catres/:进行 edto_aro、limchi2 和 catres 操作。

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