rosetta蛋白质设计软件中EnzRepackMinimize name=desmin design=1 repack_only=0scorefxn_minimize=myscore scorefxn_repack=soft_rep minimize_rb=1minimize_sc=1 minimize_bb=0 cycles=2 minimize_lig=1 min_in_stages=0ba
这是一个关于 Rosetta 蛋白质设计软件中的 EnzRepackMinimize 操作的命令,具体含义如下:
- name=desmin:命名为 desmin。
- design=1:进行设计操作。
- repack_only=0:同时进行重构和设计。
- scorefxn_minimize=myscore:使用自定义的 myscore 评分函数进行最小化。
- scorefxn_repack=soft_rep:使用 soft_rep 评分函数进行重构。
- minimize_rb=1:进行侧链和主链的最小化。
- minimize_sc=1:进行侧链的最小化。
- minimize_bb=0:不进行主链的最小化。
- cycles=2:进行两个循环。
- minimize_lig=1:进行配体的最小化。
- min_in_stages=0:不分阶段进行最小化。
- backrub=0:不进行 Backrub 操作。
- task_operations=edto_aro,limchi2,catres/:进行 edto_aro、limchi2 和 catres 操作。
原文地址: https://www.cveoy.top/t/topic/cluB 著作权归作者所有。请勿转载和采集!