rosetta蛋白质设计软件中dock_designSCOREFXNSmyscore weights=enzdeswtsSCOREFXNSTASKOPERATIONSDetectProteinLigandInterface name=edto_aro design=1 cut1=60 cut2=80cut3=100 cut4=120 preserve_aromatics=1DetectProtei
这是一段Rosetta蛋白质设计软件的代码,用于进行蛋白质-配体的结合模拟和设计。其中包括了不同的任务操作(TASKOPERATIONS)、评分函数(SCOREFXNS)、过滤器(FILTERS)和移动器(MOVERS),以及最终的协议(PROTOCOLS)来执行这些操作。这些操作包括检测蛋白质-配体接口、限制芳香族氨基酸的构象、设置催化残基的设计行为、添加/删除匹配的约束等。最终目的是优化蛋白质-配体的结合能力,并筛选出符合要求的设计结果。
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