Rosetta蛋白质设计脚本req packstat value 058 req sc_value value 048 req delta_unsatHbonds value 1788 req dG_separateddSASAx100 value -153 output sortmin dG_separated 什么意思
这段脚本是在对Rosetta蛋白质进行设计时设置的一些限制条件,其中:
- req packstat value > 0.58:要求设计后的蛋白质具有较好的紧密度,即packstat值大于0.58。
- req sc_value value > 0.48:要求设计后的蛋白质侧链能量得分较低,即sc_value值大于0.48。
- req delta_unsatHbonds value < 17.88:要求设计后的蛋白质不应有过多的未饱和氢键,即delta_unsatHbonds值小于17.88。
- req dG_separated/dSASAx100 value < -1.53:要求设计后的蛋白质具有较低的相对自由能,即dG_separated/dSASAx100值小于-1.53。
- output sortmin dG_separated:输出结果按照dG_separated值从小到大排序。
简而言之,这段脚本是在对蛋白质进行设计时设置了一些限制条件,并且要求输出结果按照相对自由能从小到大排序。
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