蛋白质设计软件 rosetta脚本中perl $WRKDIRrosettamainsourcesrcappspublicenzdesDesignSelectpl -d grep SCORE interfacessc -c metric_thresholds_2txt -tag_column last filtered_interfacessc 什么意思
这段脚本的作用是使用Rosetta软件中的enzdes/Design模块进行蛋白质设计。具体步骤如下:
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从interfaces.sc文件中筛选出得分高的界面(interface)信息,使用grep命令实现。
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将得分高的界面信息作为输入参数传递给Design模块的Select.pl脚本。
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在Select.pl脚本中,使用metric_thresholds_2.txt文件中定义的阈值来筛选出符合要求的界面信息,并将结果保存到filtered_interfaces.sc文件中。
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最后,使用-tag_column选项将最后一列作为标签添加到filtered_interfaces.sc文件中。
具体命令参数的含义如下:
-d:指定输入文件(即得分高的界面信息)。
-c:指定阈值文件。
-tag_column:指定要添加的标签列。
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