蛋白质设计软件 rosetta脚本中req packstat value 058 req sc_value value 048 req delta_unsatHbonds value 1788 req dG_separateddSASAx100 value -153 output sortmin dG_separated 什么意思
这段脚本是针对蛋白质设计的,其中包含了一些要求和输出指令:
- req packstat value > 0.58:要求设计的蛋白质分子的紧密度(packstat)值大于0.58。
- req sc_value value > 0.48:要求设计的蛋白质分子的侧链得分(sc_value)值大于0.48。
- req delta_unsatHbonds value < 17.88:要求设计的蛋白质分子的不饱和氢键数(delta_unsatHbonds)值小于17.88。
- req dG_separated/dSASAx100 value < -1.53:要求设计的蛋白质分子的自由能(dG_separated)与溶剂可及表面积(SASA)的比值小于-1.53。
- output sortmin dG_separated:输出设计的蛋白质分子的自由能(dG_separated)的最小值。
总体来说,这段脚本是要求设计的蛋白质分子在满足一定的物理化学要求的前提下,使自由能最小化。
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