使用NNK简并密码子进行饱和突变测序结果发现很多都是亲本没有发生突变如何解决？

出现这种情况可能有以下几个原因：

1. 实验条件不够理想，如反应时间、温度、酶的浓度等没有控制好，导致反应效果不好。

解决方法：重新优化实验条件，如调整反应时间、温度、酶的浓度等。

2. NNK简并密码子有一定的随机性，有可能会出现全部为亲本的情况。

解决方法：增加反应次数或者扩大突变库规模，提高突变率。

3. 部分基因可能不适合使用NNK简并密码子进行饱和突变，需要根据具体情况选择其他突变方法。

解决方法：根据具体基因的特点，选择合适的突变方法进行突变。