mol如何进行本地加载pdb数据
Mol是一个在网页上运行的分子结构可视化工具,因此默认情况下它不支持本地加载pdb数据。不过,如果您想要在本地使用Mol加载pdb数据,可以参考以下步骤:
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下载Mol*的源代码,可以从GitHub上获取:https://github.com/molstar/molstar。
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安装Node.js和npm,以便在本地运行Mol*。
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在Mol*的代码目录中打开命令行,运行以下命令安装依赖项:
npm install
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将您要加载的pdb数据文件放在Mol*代码目录中的“examples”文件夹中。
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打开Mol*代码目录中的“src/examples/structure/basic-structure.ts”文件,找到以下代码:
async load() {
const data = await download('rcsb://5ios.mmtf.gz');
await this.ctx.customModel.setDefaultFull(data);
}
- 将其中的“rcsb://5ios.mmtf.gz”改为您要加载的pdb数据文件的路径,例如:
async load() {
const data = await download('examples/1aon.pdb');
await this.ctx.customModel.setDefaultFull(data);
}
- 运行以下命令启动Mol*的本地服务器:
npm run start
- 打开浏览器,在地址栏中输入“http://localhost:8080”,即可在本地使用Mol*加载pdb数据文件。
注意:本地加载pdb数据需要您自己解析和处理数据,因此可能需要您有一定的编程能力。
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