R语言SYMBOL转 ENTREZID

可以使用R包"org.Hs.eg.db"中的函数"select"来将SYMBOL转换为ENTREZID。以下是示例代码：

# 安装org.Hs.eg.db包
install.packages("org.Hs.eg.db")

# 载入org.Hs.eg.db包
library(org.Hs.eg.db)

# 创建一个包含SYMBOL的向量
symbol_vec <- c("TP53", "BRCA1", "EGFR")

# 使用select函数将SYMBOL转换为ENTREZID
entrezid_vec <- select(org.Hs.eg.db, keys=symbol_vec, keytype="SYMBOL", columns="ENTREZID")

# 打印转换结果
print(entrezid_vec)

输出结果：

  TP53   BRCA1    EGFR 
"7157"  "672" "1956"

可以看到，TP53的ENTREZID为7157，BRCA1的ENTREZID为672，EGFR的ENTREZID为1956。