使用dask读写hdf5文件数据集为Sshape为76007600300
首先需要安装dask和h5py库:
!pip install dask h5py
然后可以使用dask.array来读写hdf5文件:
import dask.array as da
import h5py
# 读取hdf5文件
with h5py.File('data.hdf5', 'r') as f:
dset = f['S']
shape = dset.shape
# 创建dask数组,使用块大小为1000
S = da.from_array(dset, chunks=(1000, 1000, 300))
# 对S进行操作
S_mean = S.mean(axis=0)
# 写入hdf5文件
with h5py.File('result.hdf5', 'w') as f:
dset = f.create_dataset('S_mean', shape=S_mean.shape, dtype=S_mean.dtype)
da.store(S_mean, dset)
以上代码中,我们使用了h5py库来读取和写入hdf5文件,使用了dask.array来处理数据。在读取hdf5文件时,我们通过from_array方法创建了一个dask数组,并指定了块大小为1000,这意味着数据被分成了(8, 8, 1)个块,每个块的大小为(1000, 1000, 300)。在对S进行操作时,dask会自动将操作应用于每个块,最终返回结果。在写入hdf5文件时,我们使用了store方法将dask数组的结果写入hdf5文件中。
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