深圳市COVID-19传播动力学和潜伏期估计
深圳市COVID-19传播动力学和潜伏期估计
本研究收集了深圳市卫生健康委员会公布的COVID-19确诊病例数据(截至2020年2月22日)。根据最新数据,截至2月22日,深圳市累计确诊病例417例,截至2月27日,确诊病例数未发生变化。通过对公开发布信息的分析,我们确定了27条传播链,其中23名感染者仅与一名传播者相关联。
潜伏期估计
本研究使用三种参数概率分布(Weibull、Lognormal和Gamma分布)来拟合COVID-19的潜伏期(SI),并使用最大似然估计方法计算了SI的均值(μ)和标准差(σ)。使用校正的赤池信息准则(AIC)比较了这三种模型的拟合性能。
传播动力学模型
在估计SI的基础上,我们使用logistic增长模型拟合了深圳市COVID-19本地病例的时间序列。通过该模型,可以估计疫情的增长速率(γ)。我们使用基本再生数(R0)的公式 R0 = M(-γ)(Wallinga和Lipsitch,2007)来估计R0,其中M(∙)是SI的概率密度函数(GI的代理)的矩生成函数。
结论
本研究基于深圳市的COVID-19疫情数据,对潜伏期进行了估计,并建立了传播动力学模型。研究结果可为深圳市乃至全国的疫情防控提供科学依据。
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