霍氏肠杆菌全基因组测序样本准备指南

本指南提供了霍氏肠杆菌全基因组测序 (WGS) 的样本准备步骤，以确保获得高质量的测序数据。

1. 样本采集和处理

样本类型: 霍氏肠杆菌样本可以从各种来源获得，包括细菌培养物、食品样品和环境样品。
采集方法: 使用无菌技术采集样本，以最大程度地减少污染。
存储: 在处理之前，应将样本储存在适当的温度（例如 -80°C 或 -20°C）下。

2. DNA 提取

使用针对样本类型的商用 DNA 提取试剂盒提取霍氏肠杆菌的总 DNA。
遵循制造商的说明进行操作，以确保最佳的 DNA 产量和质量。

3. DNA 质量控制

使用分光光度计测量 DNA 浓度（ng/μL）。
通过计算 A260/A280 比率来评估 DNA 纯度，该比率应在 1.7 到 1.9 之间。
通过凝胶电泳确认 DNA 的完整性，以确保没有降解。

4. 样本准备表

以下是一个示例样本准备表，可在 WGS 实验中用于记录样本信息:

| 样本编号 | 采集日期 | 采集地点 | 样本类型 | 采集方法 | 存储方法 | DNA提取方法 | DNA浓度（ng/μL） | DNA质量（A260/A280） | |---|---|---|---|---|---|---|---|---| | Sample 1 | 2022-01-01 | 医院 A | 细菌培养液 | 将菌落转移到无菌培养基中培养 | -80℃冷冻保存 | 商用DNA提取试剂盒 | 100 | 1.8 | | Sample 2 | 2022-01-02 | 食品加工厂 | 食品样品 | 采集食品表面刮取物 | -20℃冷冻保存 | 商用DNA提取试剂盒 | 200 | 1.9 | | Sample 3 | 2022-01-03 | 环境 A | 水样 | 采集水样并过滤 | -20℃冷冻保存 | 商用DNA提取试剂盒 | 150 | 1.7 |

注意: 此样本准备表中的信息仅供参考。请根据您的具体实验设计和样本来源调整内容。

5. 结论

通过遵循这些指南，您可以确保获得适用于 WGS 的高质量霍氏肠杆菌 DNA，从而获得可靠且准确的测序结果。