在这项实验中，感染金黄色葡萄球菌的组相较于对照组，其拟杆菌门的比例有明显的上升，而对应的厚壁菌门的比例则下降。变形菌门对比差异不大。这意味着感染金黄色葡萄球菌的小鼠在厚壁菌/拟杆菌方面的比例将大幅下降。研究表明，这一比例的降低与炎症性肠病（IBD）有关。

同时，感染组的肠道微生物群落的多样性也有所下降，这可能与金黄色葡萄球菌的感染引起的炎症反应有关。此外，感染组中拟杆菌属的数量明显增加，其中包括一些可能与肠道健康密切相关的菌株，如肠杆菌属（Escherichia）和双歧杆菌属（Bifidobacterium）。这些结果提示，金黄色葡萄球菌感染可能会改变肠道微生物群落的组成，从而影响肠道健康。