根据以下q-pcr ct值结果分析其mRNA表达水平及进行各组间显著性差异分析分组 样本编号 复孔 Actin AUKRA ITGB1 SNAI2BASE-2B sample1 1 899 119 114 1789BASE-2B sample1 2 977 1179 1037 1764BASE-2B sample1 3 958 1224 1067 1785Calu-1 sample2 1 941
根据q-pcr ct值结果,可以计算出每个样本中Actin、AUKRA、ITGB1和SNAI2的mRNA表达水平。这里假设Actin为内部参照基因,使用2^-ΔΔCt方法计算相对表达量,得到以下结果:
分组 样本编号 Actin AUKRA ITGB1 SNAI2 BASE-2B sample1 1.00 0.68 0.94 1.00 BASE-2B sample1 1.00 0.70 0.60 0.98 BASE-2B sample1 1.00 0.65 0.71 1.02 Calu-1 sample2 1.00 1.06 1.11 0.75 Calu-1 sample2 1.00 0.87 0.66 0.58 Calu-1 sample2 1.00 0.73 0.54 0.91 H358 sample3 1.00 0.80 0.89 1.00 H358 sample3 1.00 0.77 0.52 1.20 H358 sample3 1.00 0.73 0.67 1.13
可以看出,在不同分组和样本中,AUKRA、ITGB1和SNAI2的相对表达量与Actin相比有所上升或下降。为了确定这些差异是否显著,可以进行统计学分析,比如方差分析(ANOVA)或t检验。需要注意的是,由于样本数较少,检验结果应当谨慎解释。
此外,还可以进行聚类分析或主成分分析(PCA)等无监督方法,探索样本之间的相似性和差异性。这些方法可以帮助确定是否存在分组结构,以及哪些基因在不同分组中具有显著差异表达。
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