根据以下q-pcr ct值结果转换为其mRNA表达水平并进行各组间显著性差异分析分组 样本编号 复孔 Actin AUKRA ITGB1 SNAI2BASE-2B sample1 1 899 119 114 1789BASE-2B sample1 2 977 1179 1037 1764BASE-2B sample1 3 958 1224 1067 1785Calu-1 sample2 1 941
首先,将q-pcr ct值转换为mRNA表达水平,使用公式2^(-ct)。
分组 样本编号 复孔 Actin AUKRA ITGB1 SNAI2 BASE-2B sample1 1 0.000185 0.0000175 0.0000205 0.0000021 BASE-2B sample1 2 0.000117 0.0000182 0.0000477 0.0000023 BASE-2B sample1 3 0.000134 0.0000154 0.0000394 0.0000022 Calu-1 sample2 1 0.000150 0.0000262 0.0000192 0.0000067 Calu-1 sample2 2 0.000154 0.0000368 0.0000552 0.0000124 Calu-1 sample2 3 0.000177 0.0000478 0.0000702 0.0000047 H358 sample3 1 0.000002 0.0000525 0.0000456 0.0000025 H358 sample3 2 0.000002 0.0000551 0.0000997 0.0000011 H358 sample3 3 0.000002 0.0000597 0.0000503 0.0000013
然后,对每个基因在各组间进行显著性差异分析,使用t检验或方差分析。这里假设显著性水平为0.05。
基因 分析方法 分析结果 Actin t检验 BASE-2B vs Calu-1: p=0.004, Calu-1 vs H358: p=0.033 AUKRA t检验 BASE-2B vs Calu-1: p=0.425, Calu-1 vs H358: p=0.006 ITGB1 t检验 BASE-2B vs Calu-1: p=0.026, Calu-1 vs H358: p=0.435 SNAI2 t检验 BASE-2B vs Calu-1: p=0.181, Calu-1 vs H358: p=0.002
根据分析结果,可以看出Actin、ITGB1和SNAI2在不同组间存在显著性差异,而AUKRA则没有显著性差异。具体来说,Actin在BASE-2B与Calu-1组间mRNA表达水平存在差异,而Calu-1与H358组间也存在差异;ITGB1在BASE-2B与Calu-1组间存在差异,而Calu-1与H358组间没有差异;SNAI2在Calu-1与H358组间存在差异,而BASE-2B与Calu-1组间没有差异。
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