根据以下q-pcr ct值结果分析其mRNA表达情况及进行显著性差异分析分组 样本编号 复孔 Actin AUKRA ITGB1 SNAI2BASE-2B sample1 1 899 119 114 1789BASE-2B sample1 2 977 1179 1037 1764BASE-2B sample1 3 958 1224 1067 1785Calu-1 sample2 1 941 112
首先,qPCR ct值越低,表示该基因在样本中的表达量越高。
根据上表中的结果,可以看出:
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Actin基因在所有样本中的ct值都比较低,说明其在各组细胞中都有较高的表达量,可以作为内部参照基因来进行差异分析。
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AUKRA、ITGB1、SNAI2基因在不同细胞系中的表达程度不同,但在同一细胞系内的重复样本中ct值的差异比较小,说明实验重复性较好。
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要进行显著性差异分析,需要进行标准化处理。一种常用的方法是采用2^-ΔΔCt法,即将目标基因的ct值减去内部参照基因的ct值,得到ΔCt值,再将每个样本的ΔCt值减去对照组的ΔCt值,得到ΔΔCt值。最后,通过计算2^-ΔΔCt,得到相对表达量的折算值,进行统计分析。
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在进行差异分析时,可以采用t检验、方差分析(ANOVA)等方法,对不同组之间的表达量进行比较,找出显著性差异的基因。
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