甲烷氧化菌分类：I型、II型和X型

基于细胞内结构、系统发育和碳代谢途径，甲烷氧化菌可以分为两类——I型和II型（Green，1992）。I型甲烷氧化菌的细胞膜中有许多囊泡状的盘片束，并利用核糖醇单磷酸（RuMP）作为碳同化的主要途径。许多I型甲烷氧化菌与甲烷球菌科（γ-变形菌门）相关，包括甲基杆菌属、甲基单胞菌属、微小甲基菌属和甲基硫菌属（Bratina等，1992；Hanson和Hanson，1996）。与I型相反，II型甲烷氧化菌的成员细胞周围有成对排列的膜，并利用丝氨酸途径同化碳（Hanson和Hanson，1996）。所有II型甲烷氧化菌都属于α-变形菌门，代表家族为甲烷囊菌科，包括甲烷囊菌属、甲烷假单胞菌属和甲烷硫菌属（Bratina等，1992；Hanson和Hanson，1996）。

新分类的X型甲烷氧化菌也与γ-变形菌门相关，与I型成员相似。X型甲烷氧化菌主要包括甲基球菌属和甲基热菌属，该组成员利用RuMP和丝氨酸途径，在高温环境中广泛分布（Bratina等，1992）。与I型相比，X型甲烷氧化菌的DNA中含有高的G+C含量。