而基于分子建模的组合药物发现方法也常常受限于

以下几个方面：

1. 分子模型的准确性：分子模型的准确性会影响到药物的设计和发现，如果分子模型的准确性不高，可能会导致设计的药物无法发挥预期的效果。

2. 化合物的多样性：组合药物需要考虑化合物之间的相互作用和协同作用，因此需要选择多样性的化合物进行组合设计。但是，化合物的多样性往往会增加药物设计的难度和复杂度。

3. 适用性和可行性：组合药物需要考虑到化合物之间的相互作用和药物副作用等因素，因此需要进行大量的实验验证。这可能会导致组合药物的发现过程变得复杂和昂贵。

4. 数据量和计算资源：组合药物发现需要大量的化合物数据和计算资源支持，而这些数据和计算资源往往是昂贵的，因此可能会限制组合药物发现的速度和规模。