修改下面这句话 我们将上调的三组基因进行功能富集分析如图3-6 A所示上调Overlapped组的基因能够富集在与细胞增殖相关的功能通路中如细胞周期调控、有丝分裂循环和DNA复制正调控等。上调GEGs-only组基因主要富集在跨突触信号、无机阳离子跨膜转运、核苷酸-糖的生物合成过程等细胞信号传递和代谢过程中。不同于上调的GEGs-only组上调DRPGs-only组的基因能够富集在包括凋亡相关
我们对上调的三组基因进行了功能富集分析,如图3-6 A所示。上调Overlapped组的基因能够富集在与细胞增殖相关的功能通路中,如细胞周期调控、有丝分裂循环和DNA复制正调控等。上调GEGs-only组基因主要富集在跨突触信号、无机阳离子跨膜转运、核苷酸-糖的生物合成过程等细胞信号传递和代谢过程中。与上调的GEGs-only组不同,上调DRPGs-only组的基因能够富集在包括凋亡相关信号通路、阳性调节ERBB信号通路等与肿瘤进展密切相关的功能上。
我们还对下调的三组基因进行了功能富集分析(图3-6 B)。结果显示,下调Overlapped组基因主要富集在一元羧酸代谢、有机羟基化合物代谢、脂质分解代谢过程以及对无机物和药物反应等生物过程中。下调GEGs-only组基因主要富集在离子通路相关功能,如能量耦合质子跨膜转运对抗电化学梯度、电子传输耦合质子传输。而下调DRPGs-only组基因可以富集到具有Ras蛋白信号转导、调控细胞形态和小GTPase介导的信号转导的功能上。综上结果提示,联合启动子层面进行的分析可作为研究HCC肿瘤发生发展的有效补充。
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