蛋白质量设计软件rosetta如何控制突变的残基个数
Rosetta蛋白质量设计软件可以通过调整参数来控制突变的残基个数。具体来说,可以使用以下几个参数来控制突变的数量:
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-ex1:该参数控制是否对侧链进行自由度较小的采样。设置为true时,只会对侧链进行较小范围的采样,从而减少突变的数量。
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-ex2:该参数控制是否对侧链进行自由度较大的采样。设置为true时,会对侧链进行较大范围的采样,从而增加突变的数量。
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-ex3:该参数控制是否对侧链进行自由度最大的采样。设置为true时,会对侧链进行最大范围的采样,从而进一步增加突变的数量。
通过调整这些参数的取值,可以控制突变的残基个数,从而进行蛋白质的质量设计。不同的参数组合可以得到不同数量的突变结果,研究人员可以根据实际需求选择合适的参数来控制突变的数量。
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