1删除所有的符号2删除所有带Contig的行3将每两个Chr开头的行中间的行合并成1行Linux中对下面文件进行处理并且达到上面的要求Chr1ASCDJSVHUIDSHNGDUHVDVHJKSNUJKDFHDUDSNFJDNSFJJFHJSJKHFChrtestContig 1DXVXKJCVBHKXCBVKJBNSJEHFUSHDBNJKBGSHBGKJSBDGKJBSDKContig 141F
可以使用以下命令对文件进行处理:
sed -e '/>/s/>//g' -e '/Contig/d' -e '/^Chr./{N;s/\n//;}' file.txt > new_file.txt
解释如下:
- -e '/>/s/>//g':删除所有的>符号;
- -e '/Contig/d':删除所有带Contig的行;
- -e '/^Chr./{N;s/\n//;}':将每两个Chr开头的行,中间的行合并成1行。
最终结果会输出到new_file.txt文件中。
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