蛋白质-蛋白质对接工具大全：开发人员和参考文献

蛋白质-蛋白质对接是结构生物学和药物发现中的一个重要过程。为此目的，已经开发了许多工具。以下是蛋白质-蛋白质对接工具的详细列表，包括它们的开发人员和参考文献：

1. ClusPro - 开发人员：波士顿大学 - 参考文献：Comeau et al., Nucleic Acids Research, 2004

2. HADDOCK - 开发人员：乌得勒支大学和EMBL - 参考文献：Dominguez et al., Proteins, 2003

3. ZDOCK - 开发人员：加州大学圣地亚哥分校 - 参考文献：Chen et al., Proteins, 2003

4. PatchDock - 开发人员：特拉维夫大学 - 参考文献：Schneidman-Duhovny et al., Nucleic Acids Research, 2005

5. GRAMM-X - 开发人员：华沙大学 - 参考文献：Tovchigrechko et al., Nucleic Acids Research, 2006

6. RosettaDock - 开发人员：华盛顿大学 - 参考文献：Gray et al., Proteins, 2003

7. ATTRACT - 开发人员：巴塞罗那大学 - 参考文献：Schindler et al., Proteins, 2007

8. HEX - 开发人员：爱丁堡大学 - 参考文献：Ritchie and Venkatraman, Proteins, 1999

9. pyDock - 开发人员：巴塞罗那大学 - 参考文献：Jimenez-Garcia et al., Proteins, 2013

10. PIPER - 开发人员：斯克里普斯研究所 - 参考文献：Yan et al., Proteins, 2017

其他工具：

除了以上列出的工具外，还有许多其他蛋白质-蛋白质对接工具可用，包括：

SwarmDock* CDOCKER* PIPER-FlexPepDock* SwarmDock-CABSflex* DockingServer* FRODOCK* MEGADOCK* FireDock* PIPER-FlexPepDock-Web* PIPER-FlexPepDock-CABSflex* 3dRPC* SwarmDock-CABSflex-Web* pyDockWEB* PIPER-FlexPepDock-Web-Server* PIPER-FlexPepDock-CABSflex-Web* CABS-dock* CABS-dock-Web* CABS-dock-Web-Server* CABS-dock-Web-Server-HADDOCK* CABS-dock-Web-Server-GRAMM-X* CABS-dock-Web-Server-ATTRACT* CABS-dock-Web-Server-HEX* CABS-dock-Web-Server-FireDock* CABS-dock-Web-Server-3dRPC* CABS-dock-Web-Server-SwarmDock* CABS-dock-Web-Server-ClusPro* CABS-dock-Web-Server-RosettaDock* CABS-dock-Web-Server-pyDock* CABS-dock-Web-Server-DockingServer* CABS-dock-Web-Server-FRODOCK* CABS-dock-Web-Server-MEGADOCK* CABS-dock-Web-Server-SwarmDock-CABSflex* CABS-dock-Web-Server-pyDockWEB

请注意，其余工具可能没有现成的具体参考文献或开发人员。建议单独搜索每个工具以找到更多信息。