配体结合过程中峡谷水分子作用机制研究

在配体结合过程中，某些水分子会被排斥出去，而另一些则保持在与其在天然酶中类似的位置。这些被埋藏的水分子可能具有多种作用，包括充当润滑剂，使形成峡谷壁的环状结构能够进行大幅度的波动。这种波动有助于底物、产物和水分子进出活性位点。由于配位能力较差，与体相水相比，峡谷水分子更容易被底物取代。峡谷水分子的相对松散排列留下了许多小的空隙，底物和抑制剂可以更有效地填充这些空隙，这可能是配体结合的主要驱动力。