请帮我写一个使用fsl批量去除mcinii图像小脑的shell脚本

以下是使用fsl批量去除mci.nii图像小脑的shell脚本：

#!/bin/bash

# 设置工作目录
cd /path/to/your/data

# 循环遍历所有的mci.nii文件
for file in $(ls *mci.nii)
do
  # 提取文件名（不包含扩展名）
  filename=$(basename $file .nii)

  # 使用fslmaths去除小脑
  fslmaths $filename.nii -mul $filename"_mask.nii" $filename"_brain.nii"
done

这个脚本假设你的mci.nii文件和对应的小脑掩模文件都在同一个目录下，并且掩模文件的命名规则为<filename>_mask.nii。

脚本会循环遍历所有的mci.nii文件，提取文件名并使用fslmaths命令将小脑从图像中去除，最终输出以<filename>_brain.nii命名的新文件。