如何使用python进行R型聚类

Python中的Scipy库提供了一个现成的函数可以用来进行R型聚类，该函数为scipy.cluster.hierarchy.linkage()。下面是一个简单的示例代码：

import numpy as np
from scipy.cluster.hierarchy import linkage, dendrogram

# 生成一些随机数据
X = np.random.rand(10, 5)

# 计算距离矩阵
Z = linkage(X, method='ward', metric='euclidean')

# 绘制树状图
dendrogram(Z)

在这个例子中，我们使用numpy生成了一个10行5列的随机矩阵X，然后使用linkage()函数计算了其距离矩阵Z，其中method参数指定了聚类算法，这里使用了ward算法，metric参数指定了距离度量方式，这里使用了欧式距离。最后，我们使用dendrogram()函数绘制了树状图。

需要注意的是，在使用linkage()函数时，输入的数据矩阵应该是样本在行上的，而不是样本在列上的。如果数据矩阵是样本在列上的，需要先进行转置。